Deve ser a proporção que não está correta, basta configurar uma resolução com proporção igual a da nativa do seu monitor, caso a nativa nao seja suportada no boot. Use a opção "video info" no menu do Chameleon para ver as resoluções suportadas. Para configurar o "Graphics Mode" pode usar o Chameleon Wizard.
Por exemplo, o seu display deve ser widescreen (16:10), se a resolução nativa não for suportada, use 1280x800 que funciona na maioria e tem a mesma proporção.
Caso nenhuma resolução widescreen seja suportada, você pode redimensionar a imagem num editor gráfico para compensar a diferença na proporção.
Por exemplo, se o boot está em 1024x768 (4:3), redimensione a imagem boot.png do tema de 105x105 para 87x105.