Não, a instalação não precisa ser feita assim, pelo menos na minha última tentativa não consegui instalar no pen drive por essa opção.
O que precisa fazer é configurar o BIOS para fazer boot do pen drive no modo UEFI. Se fizer no modo legacy (se aparecer o número 7 no canto superior esquerdo da tela) não vai ter aquela opção que precisamos no menu do Clover.