Não tem nada a ver uma coisa com a outra.
Na atualização do sistema deu kernel panic porque o kernel (arquivo "mach_kernel" na raiz da partição) foi atualizado, substituído pelo original mais atual, que não tem suporte a CPU AMD.
Não existe fórmula mágica para atualizar o Chameleon, é um arquivo (chamado "boot") na raiz da partição, só substituir pelo mais atual e pronto. Se quiser usar um aplicativo para isso, a opção é sua.