Você tem que aplicar o patch sobre a DSDT original. O problema pode ser que você está aplicando sobre o do "DSDTPatcherGUI", esse programa é antigo, do tempo do Leopard, e os patches que ele aplica não fazem muita diferença (mas podem interferir no patch específico pra sua placa, feito pelo MaLd0n).
Remova o dsdt.aml antigo, reinicie e aplique o patch novamente, aí deve funcionar bem, inclusive o shutdown.